北京大学前沿交叉学科研究院是北京大学跨学科的研究平台。2005年12月28日，学校发文成立前沿交叉学科研究院，全国人大常委会副委员长、中国科协主席、北京大学医学部主任韩启德院士担任院长，方竞教授担任常务副院长。2006年4月，前沿交叉学科研究院成立。
 

北京大学前沿交叉学科研究院以北京大学雄厚的基础学科和先进的技术学科为基础，组织联合相关的研究力量，建设具有学科前沿性和学科交叉性的科技创新平台，开展与生命、信息和材料等先进科学与高新技术相关的创新性研究工作；建设社具有良好学术交流环境、优良学科交叉研究条件、实体与虚体相结合的交叉学科研究平台；成为在国际上具有学术影响、为国家科技和社会发展做出重要贡献的研究基地。

学院的发展方针是虚实结合，摒弃浮躁，完善制度，项目带动，兼容并包，外向开放。
 

目前研究院的下设中心有生物医学跨学科研究中心、理论生物学中心、功能成像研究中心、纳米科学与技术研究中心以及环境与健康研究中心。

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